松本と申します。

FreeBSD 4.8-RELEASE-p13を利用してmysqlのレプリカ構成で利用しております。

マスタ側マシン
FreeBSD4.8-RELEASE-p13
mysql3.23.58
(portsからインストール　 WITH_CHARSET=ujis WITH_XCHARSET=allを指定)
スレーブ側マシン
FreeBSD4.8-RELEASE-p13
mysql3.23.58

以上の構成にてmysqlを利用しているのですが、スレーブ側マシンにてほぼ100%のCPU時間をmysqldが使ってしまっています。（SMPなマシンですので、vmstatでは50%と表示されておりますがFreeBSDのスレッドでは１つのCPUしかつかえないのでほぼ100%のCPU時間を使っていると思います。）
スレーブ側は秒間10程度のクエリーを処理しておりますがとても100%のCPU時間を使うとは思えません。
この問題について、どなたか情報をお持ちの方いらっしゃらないでしょうか。確認する点だけでも分かればアドバイスいただけないでしょうか。

以下に調べた事を書いております。ログには特にメッセージは表示されておりませんでした。

vmstatで確認したところ非常に多くのシステムコールが多く呼ばれている事が分かりました。trussコマンドでシステムコールを表示させた結果を添付いたします。
# vmstat 1
procs memory page disks faults cpu
r b w avm fre flt re pi po fr sr aa0 md0 in sy cs us sy id
1 3 0 1081124 1392800 6 0 0 0 55 0 0 0 214 272 164 1 36 63
1 3 0 1081124 1392796 5 0 0 0 0 0 0 0 267 303610 23 0 52 48
1 3 0 1081124 1392796 3 0 0 0 0 0 0 0 241 304534 23 0 51 49
1 3 0 1081124 1392796 3 0 0 0 0 0 0 0 250 304072 19 0 51 49
1 3 0 1081124 1392796 3 0 0 0 0 0 0 0 281 302945 20 0 51 49
1 3 0 1081124 1392796 3 0 0 0 0 0 0 0 237 304570 22 0 51 49


# truss -p 8660
poll(0x840c000,0x4,0x152e) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)
poll(0x840c000,0x4,0x152e) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)
poll(0x840c000,0x4,0x152d) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)
poll(0x840c000,0x4,0x152d) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)
poll(0x840c000,0x4,0x152c) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)
poll(0x840c000,0x4,0x152c) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)
poll(0x840c000,0x4,0x152b) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)
poll(0x840c000,0x4,0x152b) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)
poll(0x840c000,0x4,0x152a) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)
poll(0x840c000,0x4,0x152a) = 1 (0x1)
gettimeofday(0x8396828,0x0) = 0 (0x0)