A.K.I.です。

>あれからもゴソゴソと頑張っております。
>phpMyAdminで変数を見たのですが、
>
>max user connections 0
>open files limit  0  
>sql mode  0  
>thread cache size  0  
>bdb shared data  OFF  

うーん、うちで運用中のMySQLも値は同じですね。
気にはなりますが、たぶんこのあたりの値は「そんなもん」なので
しょう。