河田です。

antoku@xxxxxxxxxx writes:
 > そこで、質問です。
 > 
 > PHPは標準でMySQLへのアクセスをサポートしていますが、これは
 > 同一サーバで動くのが前提のようです。

そんな前提を聞いたことないです。
server名を指定してconnectすれば良いだけだと
思います。

 > 私のようにPHPとMySQLを別サーバにする場合、何か工夫が必要
 > でしょうか？（コンパイルオプションなど）

サーバーのMySQLのバージョンとclient (つまりPHPが
makeされる時にリンクするmysqlのライブラリ)のMySQL
バージョンは合わせておく方が良いかもしれませんが...