Showです。皆様、アドバイスありがとうございます。

> それならば[06203]のTomohiro様のおっしゃる通り、
> リレーションを組んだ方が効率的だと思います。

そうですね。改めて考えるに、10000カラムを設けて1つの
テーブルに押し込める必要は（必ずしも）ありませんでした。
今、[06203]で提示された形で不都合がないか検討しています。

ただ、付与データがほぼユニーク（ex.タイムスタンプ）なので
以下の２案でトータルの大きさは大差ない（？）ことになります。

A)5000社×2万レコード＝1億レコードのテーブル一つ
B)5000社の個別テーブル×2万レコード

このようなケースで
■各社の要求により、該当社の全レコードをリスト出力する。
■または、該当社の中の一定条件のレコードのみをリスト出力する。
という作業が中心の場合、A),B)のどちらが効率的なのでしょうか？

＃　確かに共有サーバで“負荷を厭わない”のは配慮不足でした。
＃　出来るだけ負荷の少ない方法を検討します。