雄也です．

> 現在使用している端末でＭｙｓｑｌのコマンドを入力してエラーになった場合
> Beep音が鳴るので、これを止める方法を御存知の方教えて下さい。

鳴らせている部分をなくせば，だまらせることができます．

--- mysql-3.23.52.orig/client/mysql.cc	Wed Aug 14 07:08:14 2002
+++ mysql-3.23.52/client/mysql.cc	Tue Aug 27 17:58:45 2002
@@ -2307,7 +2307,7 @@
     }
     if (info_type == INFO_ERROR)
     {
-      putchar('\007');				/* This should make a bell */
+      /* putchar('\007'); */			/* This should make a bell */
       vidattr(A_STANDOUT);
       if (error)
         (void) tee_fprintf(stderr, "ERROR %d: ", error);

また，出力が端末でなければだまります．
% mysql | cat
とすればいかがでしょう．

/*
 * Yuya.Nishida.
 * yuya@xxxxxxxxxx
 */