MARUです。お世話になります。
> mysql_real_escape_string() を使っても、同じ結果でしょうか？
> 
私もドキュメントを見て、mysql_real_escape_stringを使ってみよう
と思いましたが、使用しているライブラリ(LIBMYSQL.LIB)からその関
数がエクスポートされていないようなので、mysql_escape_stringを
使っています。また、mysql_escape_string関数が原因かと思い、自分
でエスケープ処理する関数を作りましたが、結果は同じでした。
mysql_escape_string関数が問題ではないようです。

実際に例をあげてみると・・・
00 88 00 ・・・・のようなバイナリーデータの場合
\0 88 \0 (\の後ろの0は、0x30)・・・のようにエスケープシーケンス
に変換します。これをBLOB型のフィールドへ挿入して取り出してみると
00 88 5C 30 ・・・ のようになってしまいます。
0x88と0x5C(\)を2バイト文字と認識しているからではないでしょうか？

このような動作は、SJISでサーバを動作させた場合に発生して、EUCで
動作させた場合は正常にデータが入ります。
WINとLinuxの両方のサーバで確認しました。

PS.
mysql_real_escape_stringってLIBMYSQL.LIBからエクスポートされて
いませんよね？使っているのは、mysql-3.23.32-win.zipのものです。