岡善博@中札内です。
mysqldは、落ちていませんでした。

mysqldumpのオプションを増やして、実行したら、
mysqldump --single-transaction --no-tablespaces --set-gtid-purged=OFF \
-u zenpakudb -p zenpakudb > /home/oka/BACKUP/mysqldump_zenpakudb.dump
下記のエラーが出ました。
mysqldump: Couldn't execute 'show create table `wp_commentmeta`':\
Tablespace is missing for table `zenpakudb`.`wp_commentmeta`. (1812)

ここでwp_commentmetaの作り直しを行いました。
#cp -a /var/db/mysql20210920/zenpakudb.NEW/wp_commentmeta.ibd .
alter table wp_commentmeta DISCARD TABLESPACE;
alter table wp_commentmeta IMPORT TABLESPACE;

再度バックアップを実行。
mysqldump --single-transaction --no-tablespaces --set-gtid-purged=OFF \
-u zenpakudb -p zenpakudb > /home/oka/BACKUP/mysqldump_zenpakudb.dump
を実行したら、前のエラーが消え、次のエラーが出ました。
mysqldump: Couldn't execute 'show create table `wp_options`':\
Tablespace is missing for table `zenpakudb`.`wp_options`. (1812)

次は、wp_optionsの作り直し。
♯cp -a /var/db/mysql20210920/zenpakudb.NEW/wp_options.ibd .
alter table wp_options DISCARD TABLESPACE;
alter table wp_options DISCARD TABLESPACE;

再度dumpを実行。
mysqldump: Couldn't execute 'show create table `wp_commentmeta`':\
Tablespace is missing for table `zenpakudb`.`wp_commentmeta`. (1812)
下記のエラーに成りました。
mysqldump: Couldn't execute 'show table status like 'wp\_options'':\
Lost connection to MySQL server during query (2013)
ここで力尽きました。

2021年9月24日(金) 13:03 yoku0825 <yoku0825@mysql.gr.jp>:
yoku0825です。

MySQL 5.7.31とそれ以降では、mysqldump(のデフォルトのオプション)にはPROCESS権限が必要になりました。
ジェネラルテーブルスペースを使っていなければ(そしてたぶん使っていなさそう)、mysqldumpのオプションに
`--no-tablespaces` をつけると良いかも知れません。

https://dev.mysql.com/doc/relnotes/mysql/5.7/en/news-5-7-31.html#mysqld-5-7-31-security

しかし、エラーになったあと2013のエラーが出ているのが気になります。mysqld落っこちたような気がしますね。
mysqldのエラーログを見て、落ちていないかどうか見てあげてください。
もし落ちていたようなら、innodb_force_recoveryを上げながら少しずつ試す必要があるような気がします。
https://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/forcing-innodb-recovery.html


yoku0825,

2021年9月24日(金) 11:59 Takahiro Kambe <taca@back-street.net>:
>
> こんにちは。
>
> In message <CAHxEFg692ELWxC3TuTeaGuTmA+KPYx6ZXU3ye4EckesXV8OxNQ@mail.gmail.com>
> on Fri, 24 Sep 2021 10:36:20 +0900,
> 岡善博 <zenpaku@gmail.com> wrote:
> > mysqldump: Error: 'Access denied; you need (at least one of) the PROCESS \
> > privilege(s) for this operation' when trying to dump tablespaces
> この部分についてはmysqldumpをしようとしているユーザーに権限が足らない
> のだと思います。
>
> --
> 神戸 隆博 / Takahiro Kambe
>