藤田です。

何度もありがとうございます。

> mysql コマンドと PHP の mysqli 拡張モジュールが同じライブラリとリンクしているとは限りません。
> そして、mysqli->set_charset() は、libmysql に charset を伝えるものなので、
> libmysql が古ければ新しい charset に失敗することも（多分）あります。
> （実際そのような状態に出くわしたことは無いですが・・・）
> 
>   rpm -qa | grep -i mysql

上記コマンドで確認したところ、やはり5.5.24のものしかないようでした。

MySQL-shared-5.5.24-1.rhel5
MySQL-server-5.5.24-1.rhel5
MySQL-shared-compat-5.5.24-1.rhel5
MySQL-client-5.5.24-1.rhel5


> PHP 自体をソースからビルドするか、mysqli 拡張モジュールだけでも
> ソースからビルドすれば解決するかもしれません。

やはりそれしかなさそうですか。
今回のサーバはRPMを使うというのがもともとの要求のため、ソースからのビルドは実施が難しいのですが、
また時間がありましたテストしてみたいと思います。
アドバイスありがとうございました。


何とぞよろしくお願いいたします。