こんばんは。

現在、windows2003server+Apache2.0.59+PHP5.2.6+MySQL4.0.26で構成している
システムのデータベースのやりかえの為、MySQLのバージョンを模索しています。

今回のデータベースの変更の目的は、データが肥大化してきたためデータベースの分散 

及びテーブルの分散させ、検索を高速にすることです。

そこで「innodb_file_per_table」が有効になる4.1系以降で最新バージョンを試そうと思い
5.0.45を選択してデータ移行を行い、クエリを実行したところ劇的に遅くなりました。 

テーブルはinnodbです。
my.iniの設定はほぼ同じ設定にしています。

詳しくgoogleで調べてみたのですが、5.0リリース当時の記事ですがinnodbでは
4.1系のほうが早いというのを見つけました。

実際のところ、速度という意味ではどちらをチョイスすべきなのでしょうか？
アドバイスいただければと思い、投稿させていただきました。

ご教授の程、宜しくお願いします。

兵頭