toge@kek です。

結論は、遠藤さんの[mysql 13786]の方法で 4.1 --> 5.0 の移行はうまく行き
ました。より正確には、簡単なチェックでわかるかぎり、いまのところ上手く
いったように見えます。

つまり、

1) ユーザ設定、権限設定は、紙ベース/テキストベースのデータをもとに手動に
   て設定。

2) それ以外のデータは mysqldump > xxx.sql と mysql < xxx.sql にて移行。

1) のほうのユーザ設定、権限設定も dump / restore で格好よくバッチ的処理
ができないものか、と思いまして mysqldump -c -t / mysql < xxx.sql を試み
たのですが、restore のときエラーが出てうまく行かず、追求するのは途中で
諦めました。

コメントいただいた皆様に御礼申し上げます。

- toge