木下です。

MySQL 5.0.x が遅いという方が多いですが、
私が使用している限りは遅くなった印象を全く受けません。

以前誰かが触れていたと思いますが、多分、原因は
innodb_thread_concurrency
というパラメータの設定にあると思います。

マニュアルによると
(http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/innodb-start.html)

「Starting with MySQL 5.0.8, the default value is 20,
　and concurrency checking will be disabled if the setting is greater than or equal to 20.」

とのことで、5.0.8からは20以上の値を設定することが無制限と同じことになり、
デフォルトが20（＝無制限）となっていることが分かります。

しかしこのパラメータ、現状ではちゃんとCPUの個数かその倍程度に設定してあげないと、
多くのセッション（100程度以上）で処理を行う際に非常に多くのＣＰＵ資源を消費し
遅くなってしまいます。（バグ？？よくわかりませんが。）

というわけで
innodb_thread_concurrency
は少なくとも 19以下に設定したほうが良いです。

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木下  靖文

e-mail: kinoshita.yasufumi@xxxxxxxxxx