菅原です。

> 私はサーバの管理者であり、ユーザにはデータベース
> 作成権限を付与するのですが、SET文によりシステム変数を
> 変更させたくありません。
> (サーバのリソースをやみくもに消費させたくない為)

　SETを無効にする方法はないようですが、最大値を制限することはできるよう
です。

http://dev.mysql.com/doc/mysql/ja/set-option.html :
> SET コマンドで設定可能なサーバ変数に最大値を設定して制限する場合、--
> maximum-variable-name コマンドラインオプションを使用して最大値を指定で
> きます。 See 項4.1.1. 「mysqld コマンドラインオプション」。

　参考になりましたら。

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菅原はじめ
sugawara@xxxxxxxxxx