山本と申します。

linuxのサーバでmysql4.0.20、php4.3.8で作成したphpを
実行したところerror_logファイルに下記のようなエラー
メッセージが出力されてしまいました。

＜error_logファイルに出力されるエラーメッセージ＞
File 'NONEXISTENT/charsets/?.conf' not found (Errcode: 2)
Character set '#12' is not a compiled character set and is not specified in the 'NONEXISTENT/charsets/Index' file

ただ、プログラムの動作的にはまったく問題なく、
文字化けなどの現象も一切発生していません。

でも、エラーメッセージが表示されているのも
気持ち悪いので調べてみたところ、
「mysqlクライアントがujisをサポートしていない」
のような書き込みを見つけました。

いろいろと解決方法を検索してみたのですが
「makeしてmysqlを入れなおす」とか、基本的にmysqlを
入れなおさないといけないようなやりかたしか見つけら
れませんでした。

実は既に稼動中のサーバで、今からmysqlやphp自体を
入れなおすのはかなり難しい状況なのです。
なんとか設定ファイルの書き換えなどでこの
エラーを解決できないものかといろいろと
調べているところです。

もし、同じ問題を解決した方などいらっしゃいましたら
教えて頂けないでしょうか？
参考になるサイトだけなどでもかまいません。
よろしくお願いします。

下記に詳細な環境を記載しました。

・phpとmysqlはTurbolinux10 SERVERにデフォルトで
　インストールされていたものをそのまま使っています。
・mysqlの文字コードをmy.cnfファイルで ujis に設定しました。

＜OS＞
Turbolinux10 SERVER

＜mysql上で使用できる文字コードを表示した内容＞
mysql> show variables like 'character_set%';
+----------------+-----------------------------------------------------------
-----------------------------------------------------------------------------
---------------------------------------------------------------------------+
| Variable_name  | Value
                                                                           |
+----------------+-----------------------------------------------------------
-----------------------------------------------------------------------------
---------------------------------------------------------------------------+
| character_set  | ujis
                                                                           |
| character_sets | latin1 big5 cp1251 cp1257 croat czech danish dec8 dos esto
nia euc_kr gb2312 gbk german1 greek hebrew hp8 hungarian koi8_ru koi8_ukr lat
in1_de latin2 latin5 sjis swe7 tis620 ujis usa7 win1250 win1251ukr win1251 |
+----------------+-----------------------------------------------------------
-----------------------------------------------------------------------------
---------------------------------------------------------------------------+
2 rows in set (0.00 sec)

＜/etc/my.cnf＞
[mysqld]
default-character-set=ujis
[mysqldump]
default-character-set=ujis
[mysql]
default-character-set=ujis

＜phpの情報＞
'./configure'
 '--with-apxs2=/usr/sbin/apxs'
 '--with-openssl=yes'
 '--with-expat-dir=/usr'
 '--with-ming=shared'
 '--with-gd=shared,/usr'
 '--with-xpm-dir=/usr/X11R6/lib'
 '--enable-bz2'
 '--enable-bcmath'
 '--enable-mbstring=all'
 '--enable-mbregex'
 '--enable-sigchild'
 '--libdir=/usr/lib/php'
 '--x-libraries=/usr/X11R6/lib'
 '--includedir=/usr/include'
 '--enable-inline-optimization'
 '--with-pgsql=shared'
 '--with-imap=/usr/lib'
 '--with-ldap=shared'
 '--enable-yp'
 '--with-mysql=shared'
 '--with-mysql-sock=/var/lib/mysql/mysql.sock'
 '--prefix=/usr'
 '--exec-prefix=/usr'
 '--mandir=/usr/share/man'
 '--with-config-file-path=/etc/httpd'
 '--enable-safe-mode'
 '--disable-debug'
 '--with-zlib'
 '--enable-debugger'
 '--enable-magic-quotes'
 '--enable-ftp'
 '--enable-zend-multibyte'
 '--with-gettext'
 '--with-dom'
 '--with-dom-xslt'
 '--with-dom-exslt'
 '--with-xmlrpc'
 '--with-gdbm=/usr/lib'
 '--with-ini-file'
 '--with-flat-file'
 '--with-db4=/usr/lib'
 '--enable-dbase'
 '--enable-dio'
 '--enable-dbx'
 '--enable-filepro'
 '--enable-ftp'
 '--enable-track-vars' 

＜mysqlのバージョン＞
$ rpm -qa | grep mysql
mysql-client-4.0.20-14
mysql-bench-4.0.20-14
mysql-shared-4.0.20-14
mysql-devel-4.0.20-14
php4-mysql-4.3.8-14
mysql-server-4.0.20-14

＜phpのバージョン＞
$ rpm -qa | grep php
php4-pgsql-4.3.8-14
php4-ldap-4.3.8-14
php4-4.3.8-14
php4-ming-4.3.8-14
php4-gd-4.3.8-14
php4-mysql-4.3.8-14
php4-imap-4.3.8-14
php-pear-log-1.8.4-2