谷口です。

> 自分で作ったプログラムに同梱（逆ですけど）してみようとおもったのです
が一緒に
> 入れようとおもったらば
> エラーが出たのです。
だとすると「登録できないのはMySQLのせいではない」ですよね。
サービスに登録する方法は残念ながら私は知りません。(mysqld-nt.exeだけで
も良いか気になりますが)
知っていればお力になれるのですが...

とりあえずご自分のされている登録方法(フリーソフトやコマンドラインでの
コマンドなんかかな?)の詳しい手順や内容を提示してWindows関連のMLで質問
された方が良いかと思います。

では。
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 谷口　規久夫 / Kikuo Taniguchi
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