玉川です。
 
> 1) Linux/x86/gcc2.95
> 
> make は正常に終了しますが、
> make test で、
> 
> client_test                    [ fail ]
> 
> Errors are (from 
> /home/staff/mysql-4.1.6-gamma/mysql-test/var/log/mysqltest-time) :
> client_test: client_test.c:283: client_query: Assertion `rc 
> == 0' failed.
> /home/staff/mysql-4.1.6-gamma/client/mysqltest: command 
> "$TESTS_BINDIR/client_test --testcase --user=root 
> --socket=$MASTER_MYSOCK --port=$MYSQL_TCP_PORT" failed
> 
> で失敗します。

バグのようですね。
http://bugs.mysql.com/bug.php?id=6024
http://bugs.mysql.com/bug.php?id=6025

4.1.7で修正されているとのことです。